По результатам тематической налоговой проверки участника квазигосударственного сектора за 2020-2022 годы налоговый орган доначислил КПН на 91,8 млн тенге и НДС на 53,6 млн тенге с соответствующими пенями. Причиной доначислений стало исключение из вычетов расходов на техническое обслуживание локомотивов и замену колесных пар вагонов на общую сумму 436 млн тенге. Департамент признал сделки мнимыми, ссылаясь на включение контрагентов в список неблагонадежных налогоплательщиков после совершения операций.
Суд первой инстанции полностью удовлетворил иск компании, установив фактическое исполнение спорных договоров на основании комплексного исследования документов, опроса свидетелей и анализа видеоматериалов выполненных работ. Ключевым аргументом стало отсутствие вступивших в силу судебных решений о признании сделок недействительными, что является обязательным условием для исключения расходов из налоговых вычетов согласно статье 264 Налогового кодекса. Апелляционная инстанция подтвердила правомерность решения суда первой инстанции.
Решение основано на принципе презумпции добросовестности налогоплательщика и высоких требованиях к доказательственной базе налогового органа при оспаривании налоговых вычетов. Данное дело подтверждает необходимость строгого соблюдения налоговыми органами процедурных требований при проведении проверок и устанавливает высокий стандарт доказывания при исключении налоговых вычетов.
