По результатам тематической налоговой проверки, инициированной заявлением российского нерезидента о возврате подоходного налога, налоговый орган начислил транспортной компании корпоративный подоходный налог в размере 12,9 млн тенге и пени 2,9 млн тенге. Основанием для начислений послужила переквалификация доходов по договорам на оказание IT-услуг в роялти, подлежащие налогообложению по ставке 10% согласно международной конвенции об избежании двойного налогообложения.

Мы добились полной отмены налоговых начислений в Верховном Суде. Суд кассационной инстанции поддержал нашу позицию о том, что налоговый орган превысил свои полномочия при проведении тематической проверки. Департамент вышел за рамки заявления нерезидента о возврате налога и проверил вопросы, не связанные с предметом обращения, без получения соответствующего разрешения от уполномоченного органа.
Ключевым фактором успеха стало доказательство нарушения процедурных норм налогового законодательства. Мы обосновали, что тематические проверки по заявлениям нерезидентов должны проводиться исключительно в рамках заявленных к возврату сумм и не могут расширяться на другие договоры и периоды без специального решения Комитета государственных доходов. Превышение полномочий налогового органа привело к признанию всей проверки недействительной.